Dans un couloir, un homme (Banton) frappe à la porte de Morrisson, le résident de l'appartement 606. Banton annonce que Gail Anne est morte et que c'est sa faute. Le voisin, Patrick va regarder dans son oeil magique. L’ombre de Banton se déplace et tue le voisin. Il ne reste plus que de la cendre. Banton tourne l'ampoule pour la fermer, hurle : «non» et se sauve.
Mulder et Scully rencontrent Kelly Ryan, une ancienne élève de l'Académie devenue détective. Elle révèle qu’une autre victime, Margaret Wysnecki a disparu dans les mêmes circonstances et des cendres ont aussi été retrouvés. Mulder visualise la situation: Patrick se trouvait derrière la porte et quelque chose attirait son attention. Il remarque l'ampoule dévissée dans le couloir, il demande à ce qu’elle soit analysée pour les empreintes. À l’appartement de Margaret, en regardant dans les poubelles, Mulder voit un billet de train. Scully signale que toutes les personnes disparues ont pris le train.
À la gare, Banton est assis sur un banc et semble chercher quelque chose. Dans une ruelle, deux policiers ayant reçu l’ordre de surveiller les environs l’interceptent. Le lendemain, deux taches se trouvent sur le sol. Étant sur les lieux, Mulder explique à Scully que le tueur était là le soir précédent ainsi que les soirs où les personnes ont disparu. Les caméras de surveillance indiquent que Banton est là tous les jours et qu’il regarde le sol. En faisant un zoom, Mulder voit le logo de la compagnie Polarity Magnetics.
Les agents s'y rendent et rencontrent l’associé de Banton qui leur explique un incident ayant eu lieu et faisant Banton sa victime. Banton a voué sa vie à une expérience sur le corps noir, il devait isoler une particule et effectuer une expérience sur une cible située dans une salle isolée. Il enclenche le compte à rebours, mais remarque une erreur. Il entre dans la salle, mais il se retrouve prisonnier puisque la porte se referme derrière lui. À ce moment, Mulder, Scully et l’associé entrent dans la salle en question. L’ombre de Banton est encastrée dans le mur. L’associé se rappelle le visage de Banton, il était content de servir de cobaye.
À la gare, Mulder s'assoit sur un banc et essaie de trouver ce que Banton regardait sur le sol. Scully s'approche et dit que les empreintes sur les ampoules sont celles de Banton. Mulder remarque l'éclairage est très diffue dans cet endroit et qu’il n’a presque pas d’ombre. Mulder lance l'hypothèse que Banton cherchait son ombre puisque l’éclairage est diffue. À ce moment, Banton entre et s’enfuit lorsqu’il voit les agents. Ils le rattrapent. L’ombre est prêt de Mulder, il prend son revolver et tire sur les lumières. Banton est soulagé. Il explique que son ombre n’est plus la sienne. Le soir après l’incident, Banton s’est rendu chez Gail Anne, sa collègue. Elle était devant lui et elle est disparue. Il avoue qu’il ne contrôle pas son ombre. Il croit que le gouvernement la poursuit pour lui voler ses découvertes et qu’il n’hésitera pas pour le tuer. Mulder pense que s’il meurt, l’ombre aussi va mourir, Banton n’en est pas certain.
Kelly arrive et demande à ce que l’interrogatoire cesse. Elle présente le détective Barron aux agents. Il classe l’affaire puisque les empreintes sur les ampoules correspondent à celles de Banton. Mulder n’est pas d’accord, il évoque que Barron et Kelly ne savent pas le danger que Banton représente. Avant de partir, Mulder exige que Banton reste à la lumière douce.
Pour l’entremise de Mulder, X sait où se trouve Banton. Il se rend à sa cellule. Les lumières s’éteignent. X et deux ambulanciers viennent le chercher et l’amener au tribunal. X attend dans le couloir. Les lumières se rallument. Les ambulanciers ne sont plus que cendres. Banton s’enfuit et se rend chez Polarity Magnetics où il retrouve son associé. Il lui avoue que le corps noir est en lui, il veut le détruire parce qu’il a peur d’être tué.
Kelly, Mulder et Scully retrouvent les cendres des deux ambulanciers. Mulder pense que les employés du gouvernement sont venus le chercher. Kelly a des problèmes parce qu’elle devait s'occuper du transfert. Banton veut contrôler son ombre, Mulder sait qu’il est à l’endroit où il le peut. Au moment où Banton est prêt à détruire le corps noir, Kelly arrive arme à la main et Banton la tue. Mulder et Scully arrivent et voient les cendres de Kelly. Banton est assis dans la salle. Il a deux ombres. Mulder essaie d’ouvrir la pièce, d’après lui, quelqu’un a fermé la porte.
Mulder croise X dans le couloir. Il l’accuse de s’avoir servi de lui. Il ne veut plus jamais le voir. En partant, X révèle à Mulder que Banton est encore en vie. Mulder rejoint Scully aux funérailles de Kelly. L’associé de Banton, Christopher Davet a disparu. Morrisson West, travaillant au Polarity magnetics, a signalé sa disparition. Mulder pense que la personne dans la salle isolée n’était pas Banton, mais Christopher. Scully se demande où il est alors. Il se trouve dans une salle isolée et X étudie son cerveau. Banton pleure.