Elle naît le 2 Novembre 1755 , au palais de la Hofburg, à Vienne.C'est le jour des morts. Les cloches qui saluent sa naissance ne sonneront pas le jour de sa mort.
Ses parrain et marraine sont le roi Joseph Ier de Portugal et son épouse la reine Marie Anne Victoire d'Espagne. On apprend quelques jours plus tard qu'un tremblement de terre a ravagé Lisbonne la veille de la naissance de l'archiduchesse, jour de la Toussaint. Fâcheuse coïncidence, présage d'autres ruines et d'autres saccages qui accableront leur filleule. Le 3 Novembre jour du baptême, ils seront représentés par le frère aîné de Marie-Antoinette et une de ses soeurs.
D'aucuns y verront — surtout après coup — un mauvais présage.